Основной задачей РУПОИ является своевременное и адресное обеспечение протезно-ортопедическими изделиями (ПОИ), техническими средствами и бытовыми приспособлениями лиц с ограниченными возможностями здоровья (ЛОВЗ) с нарушениями опорно-двигательного аппарата, часто называемыми ЛОВЗ- опорниками.
Наряду с головным офисом в городе Ош работает филиал РУПОИ, обслуживающий южный регион республики.
В отдаленных районах организованы и действуют – протезно-ортопедические мастерские, производящие на местах несложный ремонт протезов и специализированной ортопедической обуви: Балыкчинская (г. Балыкчи), Нарынская (г. Нарын), Бакай-Атинская, Узгенская, Лейлекская (Исфана), Джалал –Абадская (г.Джалал Абад).
В целях создания удобства для ЛОВЗ- опорников, проживающих в отдаленных районах республики, организуется регулярные выезды бригад врачей и медтехников по месту жительства как по северному, таки по южному регионам. . На местах сбора осуществляется прием заказов, консультирование. О местах и время приема, выездная бригада РУПОИ согласовывает с сотрудниками районного управления по социальной защиты.
РУПОИ сотрудничает с ведущими производителями- поставщиками специализированных узлов, полуфабрикатов и материалов для протезирования из России, Германии и Китая.